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Dass Sphenacodontidae und Therapsida eine gemeinsame Klade bilden wird in nahezu allen entsprechenden phylogenetischen Analysen bestätigt.[1] Der Fossilbericht der Sphenacodontidae setzt im Oberkarbon (Pennsylvanium) ein. Im Falle einer streng monophyletischen Gruppe der Sphenacodontoidea sollten zur gleichen Zeit auch die frühesten Therapsiden auftauchen. Letztere lassen sich jedoch erst im Mittelperm (Guadalupium) gesichert nachweisen, was eine Lücke von etwa 35 Ma im Fossilbericht der Therapsida bedeuten würde.[2][1]
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F. Spindler: The skull of Tetraceratops insignis (Synapsida, Sphenacodontia). In: Palaeovertebrata, Band 43, Nummer 1, 2020, Artikel e1, doi:10.18563/pv.43.1.e1.
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F. Abdala, B. S. Rubidge & J. Van Den Heever: The Oldest Therocephalians (Therapsida, Eutheriodontia) and the Early Diversification of Therapsida. In: Palaeontology, Band 51, Nummer 4, 2008, S. 1011–1024, (Digitalisat).
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D.-Y. Jiang, R. Motani, J.-D. Huang, A. Tintori, Y.-C. Hu, O. Rieppel, N. C. Fraser, C. Ji, N. P. Kelley, W.-L. Fu & R. Zhang: A large aberrant stem ichthyosauriform indicating early rise and demise of ichthyosauromorphs in the wake of the end-Permian extinction. In: Scientific Reports, Band 6, Nummer 1, 2016, Artikel 26232, doi:10.1038/srep26232.
Wood wertete Stupendemys in seiner Erstbeschreibung der Gattung als Vertreter der Familie der Pelomedusidae innerhalb der Halswender-Schildkröten.<wood>